Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt34Q9D646 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms