Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PudpQ9D5U5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms