Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D5Q8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms