Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms