Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc130Q9D516 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms