Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms