Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms