Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933421I07RikQ9D420 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms