Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pus10Q9D3U0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms