Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G5

Stx11, Syntaxin-11, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx11Q9D3G5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx11Q9D3G5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx11Q9D3G5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms