Protein–RNA interactions for Protein: Q9D328

Tmem35a, Transmembrane protein 35A, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35aQ9D328 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem35aQ9D328 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms