Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H6

Sp2, Transcription factor Sp2, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp2Q9D2H6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp2Q9D2H6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms