Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms