Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mrpl28Q9D1B9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms