Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ifitm1Q9D103 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ifitm1Q9D103 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ifitm1Q9D103 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ifitm1Q9D103 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm1Q9D103 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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