Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc77Q9CZH8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms