Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl55Q9CZ83 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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