Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms