Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm8Q9CXT6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm8Q9CXT6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm8Q9CXT6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm8Q9CXT6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Kdm8Q9CXT6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Kdm8Q9CXT6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Kdm8Q9CXT6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm8Q9CXT6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms