Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sgo1Q9CXH7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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