Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xrcc3Q9CXE6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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