Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm5Q9CXE0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm5Q9CXE0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm5Q9CXE0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm5Q9CXE0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm5Q9CXE0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm5Q9CXE0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm5Q9CXE0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm5Q9CXE0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms