Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr55Q9CX97 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr55Q9CX97 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms