Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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