Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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