Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms