Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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