Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms