Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW46

Raver1, Ribonucleoprotein PTB-binding 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver1Q9CW46 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raver1Q9CW46 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms