Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms