Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms