Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms