Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms