Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQM1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQM1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQM1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQM1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQM1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms