Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rdm1Q9CQK3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rdm1Q9CQK3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rdm1Q9CQK3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rdm1Q9CQK3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rdm1Q9CQK3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rdm1Q9CQK3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rdm1Q9CQK3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rdm1Q9CQK3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rdm1Q9CQK3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rdm1Q9CQK3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rdm1Q9CQK3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdm1Q9CQK3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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