Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms