Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ergic3Q9CQE7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms