Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab5aQ9CQD1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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