Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp2Q9CQ73 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms