Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms