Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921530L21RikQ9CQ47 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4921530L21RikQ9CQ47 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms