Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms