Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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