Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2a1Q99PM3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms