Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim8Q99PJ2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms