Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsnaxip1Q99P25 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsnaxip1Q99P25 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms