Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms