Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms