Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcgf6Q99NA9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms