Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd1Q99MV1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms